המפרק האולטרה-דק פועל על בסיס שורה של עקרונות מכניים ופיזיקליים. ראשית, החומר המיועד לפירוק מוזן לתא הטחינה של המכונה. בתוך החדר, ישנם חלקים מסתובבים במהירות גבוהה, כגון דיסקים או רולים. רכיבים אלה מסתובבים במהירות גבוהה מאוד, ומייצרים כוח צנטריפוגלי חזק.
כשהחומר נכנס לאזור הטחינה, הסיבוב במהירות הגבוהה גורם לחומר להיפגע, גזירה ולטחון. הכוח המופעל על החומר מפרק אותו לחלקיקים קטנים יותר. עיצוב תא הטחינה והאינטראקציה בין מרכיבי הטחינה מבטיחים שהחומר עובר עיבוד ועידון רציף עד שהוא מגיע לגודל החלקיקים האולטרה-עדין הרצוי.
בנוסף, הפורקן האולטרה-דק עשוי גם לנצל זרימת אוויר או גז כדי לסייע בתהליך הטחינה. האוויר יכול לעזור לשאת את החומר בתוך החדר, לקדם מגע טוב יותר בין החומר לבין אלמנטי השחזה. זה גם עוזר להעביר את החלקיקים המרוסקים אל מחוץ לתא הטחינה, מונע טחינת יתר ומבטיח חלוקת גודל חלקיקים עקבית.
בסך הכל, השילוב של סיבוב במהירות גבוהה, כוחות מכניים, ובמקרים מסוימים - זרימת אוויר או גז מאפשרים לפורקר הדק במיוחד לפרק ביעילות חומרים לחלקיקים עדינים במיוחד, העומדים בדרישות של תעשיות שונות לחומרים עדינים. .